MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 19042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007606	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007606	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007606	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007606	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007606	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007606	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007606	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007606	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007606	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007606	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007606	GA	3	6	5090	5095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007606	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007606	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007606	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007606	A	6	6	6495	6500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007606	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007606	TAA	2	6	8010	8015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007606	TA	3	6	8017	8022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007606	GGCG	2	8	8079	8086	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007606	CGG	2	6	8143	8148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007606	CGT	2	6	8163	8168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007606	ATC	2	6	8172	8177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007606	CTGT	2	8	9232	9239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007606	C	6	6	9892	9897	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_007606	G	6	6	9902	9907	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007606	ATC	3	9	10499	10507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007606	GAAT	2	8	10508	10515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007606	AAT	2	6	10521	10526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007606	ATA	2	6	10562	10567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007606	GAG	2	6	10600	10605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007606	CTG	2	6	11829	11834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007606	AGA	2	6	11841	11846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007606	TCTTT	2	10	11860	11869	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007606	TTA	2	6	11870	11875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007606	T	6	6	11879	11884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007606	ATTC	2	8	11904	11911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007606	A	6	6	11984	11989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007606	TGA	2	6	12007	12012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007606	TAG	2	6	12032	12037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007606	AGTG	2	8	12046	12053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007606	A	7	7	12061	12067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007606	ATG	2	6	12123	12128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007606	AT	3	6	12134	12139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007606	A	6	6	14153	14158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007606	CCG	2	6	15382	15387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007606	GACA	2	8	15676	15683	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007606	CGC	2	6	15696	15701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007606	TAT	2	6	15702	15707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007606	TC	4	8	15709	15716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007606	T	6	6	15778	15783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007606	ATT	2	6	15793	15798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007606	ATT	2	6	15825	15830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007606	GAC	2	6	15831	15836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007606	ATT	2	6	15844	15849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007606	T	6	6	16305	16310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007606	TAAGTG	2	12	16428	16439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007606	AATG	2	8	16537	16544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007606	ATT	2	6	16617	16622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007606	AACA	2	8	16639	16646	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007606	ACA	2	6	16657	16662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007606	AATT	2	8	16663	16670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007606	TAAT	2	8	16682	16689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007606	TTC	2	6	16790	16795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007606	A	6	6	16806	16811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007606	ATT	2	6	16815	16820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007606	GAT	2	6	16845	16850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007606	GA	3	6	18124	18129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007606	CACTTA	2	12	19831	19842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007606	A	6	6	19960	19965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007606	TCT	2	6	20473	20478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007606	CAT	2	6	21229	21234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007606	GCA	2	6	21254	21259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007606	TA	4	8	21347	21354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007606	GGC	2	6	21365	21370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007606	T	6	6	21629	21634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007606	T	6	6	21642	21647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007606	CGT	2	6	21663	21668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007606	CTG	2	6	21719	21724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007606	GAG	2	6	21775	21780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007606	T	6	6	24447	24452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007606	AC	3	6	24553	24558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007606	TCT	2	6	25762	25767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007606	CCT	2	6	26646	26651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007606	A	7	7	26666	26672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007606	ATA	2	6	26682	26687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007606	TC	3	6	28834	28839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007606	CAT	2	6	28860	28865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007606	CAC	2	6	28936	28941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_007606	ACC	2	6	28984	28989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007606	TGT	2	6	29031	29036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007606	CTG	2	6	29055	29060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007606	GCG	2	6	29063	29068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007606	CCG	2	6	29085	29090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007606	GCCC	2	8	29100	29107	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_007606	GCG	2	6	29169	29174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007606	CAC	2	6	29194	29199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007606	GCTG	2	8	29240	29247	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007606	GCT	2	6	29358	29363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007606	AAAC	2	8	29400	29407	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007606	GGC	2	6	29519	29524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007606	TGG	2	6	29549	29554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007606	TGG	2	6	29586	29591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007606	TCG	2	6	29622	29627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007606	GCA	2	6	29681	29686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007606	ACC	2	6	29717	29722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_007606	ACG	2	6	29734	29739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007606	TGC	2	6	29749	29754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007606	ATG	2	6	29774	29779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007606	CGA	2	6	30511	30516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007606	GTG	2	6	30633	30638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007606	TAAAGG	2	12	30824	30835	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007606	CAG	2	6	30891	30896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007606	CAT	2	6	31130	31135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007606	GAA	2	6	31142	31147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007606	ACG	2	6	31152	31157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007606	GGC	2	6	31293	31298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007606	GCT	2	6	31397	31402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007606	CTT	2	6	31430	31435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007606	AGGC	2	8	31508	31515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007606	ACC	2	6	31620	31625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007606	CAG	2	6	31632	31637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007606	ACC	2	6	31642	31647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_007606	GAA	2	6	31719	31724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007606	AGC	2	6	31801	31806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007606	GTA	2	6	31890	31895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007606	GCC	2	6	31902	31907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_007606	CCAG	2	8	31916	31923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007606	TCG	2	6	31989	31994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007606	TAG	2	6	32050	32055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007606	AATT	2	8	32057	32064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007606	TG	3	6	32078	32083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007606	TCA	2	6	32088	32093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007606	TTA	2	6	32105	32110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007606	GAAT	2	8	32122	32129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007606	TTG	2	6	32161	32166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007606	GGCAT	2	10	32789	32798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007606	AAT	2	6	33486	33491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007606	TAA	2	6	33546	33551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007606	GTAAG	2	10	33553	33562	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007606	TCCTC	2	10	35273	35282	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_007606	GAG	2	6	35296	35301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007606	CAA	2	6	35325	35330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007606	AGG	2	6	35358	35363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007606	GTT	2	6	35848	35853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007606	T	6	6	35867	35872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007606	CAG	2	6	37605	37610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_007606	GAC	2	6	37701	37706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_007606	GC	3	6	37708	37713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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285	NC_007606	GCG	2	6	86161	86166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_007606	CCTG	2	8	86349	86356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
289	NC_007606	A	6	6	86377	86382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_007606	A	7	7	90529	90535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_007606	AG	3	6	90554	90559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_007606	TAA	2	6	90733	90738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_007606	TTA	2	6	143524	143529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_007606	TAT	2	6	162501	162506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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